磁粉制动器因过载，或磁粉质量差，扭矩不足，长期烧坏。如果长时间连续燃烧，容易影响刹车的性能和使用寿命。磁粉制动器的内部结构比较精密。如果仅靠自热冷却难以实现高效散热，那就只能加上外部散热。

　　磁粉制动器可以通过加热块冷却，虽然安装了轴流风机(鼓风机)，但是如果轴流风机的容量降低，散热效果变差，那么允许的连续滑转功率就会降低，所以安装时请务必在其周围预留一定的空间。特别是周围环境恶劣时，轴流风机的防护栅上可能会附着异物，请定期清理。

　　磁粉制动器有水冷和自冷两种，自冷是靠自身器件的铝壳罩进行的，水冷是靠水散热。这两种散热方式都是为了降低磁粉制动器的内部和表面温度。两种散热方式没有绝对的好坏，因为用途不同，选择也不同，但用户普遍更喜欢自冷磁粉制动器。